Hallo Jasmin,
melde dich mal als user an, nicht als root und versuch es mal so
Wenn es klappt, nicht wundern das deine Einstellungen weg sind. Für den Test wird eine .xbmc in deinem home Verzeichnis angelegt.
Dirch
edit: poste mal deine /etc/init/xbmc.conf, evtl. ist da was faul.