Redest du vom MPlayer, oder dem vdr-mplayer-plugin?
Der MPlayer ist ein stand-alone Programm, das völlig unabhängig vom vdr-mp3/-mplayer-Plugin ist. In diesem Fall sollte es keine Probleme geben, wenn du das vdr-mp3/-mplayer-Plugin installierst, denn da ist der stand-alone MPlayer nicht mitenthalten.
Wenn du aber das vdr-mplayer-plugin meinst, dann wundere ich mich, wie du nur dieses hast installieren können, ohne auch das vdr-mp3-plugin zu installieren, da die ja beide aus einem Archiv kommen. Vermutlich hast du dann bereits das mp3-plugin kompiliert und mußt es nur noch beim Start laden (mit -Pmp3).
Wenn du das mp3-Plugin neu kompilierst, wird normalerweise auch das mplayer-plugin neu kompiliert, aber die Einstellungen in der setup.conf bleiben erhalten.
Wenn das alles nicht zutrifft, dann schreib doch lieber mal, was du für eine Distribution einsetzt und, falls selbstgemacht, wie du den VDR installiert hast.
Gruß,
Juri
apt-get install vdr-plugin-mp3
sicherung davor machen ist doch eh selbstvertaendlich bei softwareaenderungen 
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