Hallo !
Schon folgendes probiert?
/etc/init.d/vdr stop
/var/lib/vdr/remote.conf löschen
/var/lib/vdr/remote.lirc.conf löschen
/var/lib/vdr/remote-event.conf löschen
Mit "/etc/init.d/vdr start" den vdr neustarten. Dann kommt ein Dialog um die Fernbedienung neu anzulernen. So lief es jedenfalls mit meiner Fernbedienung (Nexus 2.1).
Gruß
Norbert