... eigentlich hast Du Dir die Antwort schon selber gegeben, indem Du schreibst, dass es auf dem 350er mit DXR3 ohne Ruckler geht. Versuch doch auf dem Athlon mal die Kanotix VDR CD, damit läuft bei mir ein 1100er Athlon mit einer Pinnacle PCTV Sat und Xine als Ausgabedevice ohne Probleme. Die DXR3 läuft auf nem PIII/450 mit einer "Billigst"-Budget-Karte (Twinham, 39€, wenn ich mich richtig errinnere, dank LINVDR und Dr.Seltsam, absolut stabil. Überhaupt scheint LINVDR sehr empfehlenswert, obwohl mein dritter selbstkompilierter VDR, allerdings mit FF-Karte, auch seine Reize hat.
Also am Prozessortakt liegts bestimmt nicht. Läuft die Kanotix, so ist der Fehler in Deiner Linux Installation zu suchen, ruckelt sie, so dürfte die Hardware ein Problem haben.
... und so dann nach und nach das Problem einkreisen, genauere Diagnose über LOG-Dateien. Es gibt allerdings auch Problemfälle, wie z.B. meine Twinhan Karte, die wollte mit dem Siemens Board aus der scovery und der DXR3 nicht sauber laufen, während die gleiche Kombination in dem alten 450er Asus Board keinerlei Probleme zeigt. Manchmal hilft nur Try and Error.
good luck,
FR