Ich habe ein ähnliches Problem, aber keine für mich vollständig zufriedenstellende Lösung gefunden :-(.
Normalerweise verwende ich StarMoney unter Windows mit Chipkartenleser.
StarMoney läuft wie bereits erwähnt auch unter Linux, auch mit HBCI, aber nicht mit Chipkartenleser (liegt am Treiber+Wine).
Mit Diskette statt Chipkarte sollte es gehen und mit PIN/TAN natürlich auch (ungetestet).
Moneyplex habe ich daher als Ersatz getestet (Demoversionen verfügbar). Das Programm funktioniert auch unter Linux mit Chipkarte, konnte mich als StarMoney verwöhnten aber überhaupt nicht überzeugen.
Unter Linux verwende ich daher inszwischen Internetbanking mit Browser und PIN/TAN.
Die Opensource Anwendungen unter Linux habe ich nicht getestet. Ich halte sie entweder für noch nicht ausgereift genug (fehlende Funktionen), oder an die falsche Zielgruppe gerichtet (Firma, ich:Privat).
Monroe