Also ich hab das Problem bei mir jetzt mal "gelöst":
Ein Downgrade von Xineliboutput auf version 1.0.0 tuts, die Tonaussetzer sind weg.
Hab ich mich doch recht erinnert, dass das doch mal irgendwann kurz nach 'nem Update meines Systems angefangen hat.
Ich nutze Gentoo und hatte das Problem bei den kompletten "letzten" Versionen (In jedem Fall bei 1.0.4_p20090810 und den zwei Versionen davor).
Also ein emerge =vdr-xineliboutput-1.0.0 umgeht das Problem in meinem Fall.
Eventuell hilfts ja noch wem...
Gruß,
Marc